Áður en sílikonmottu er hreinsuð skaltu safna mildu þvottaefni, mjúkum-bursta, hreinu handklæði og fersku vatni. Notaðu fyrst mjúka-burstann til að bursta varlega allt ryk og rusl á yfirborðinu. Næst skaltu blanda þvottaefninu saman við vatn og leggja sílikonmottuna í bleyti í 15 til 30 mínútur til að losa um bletti. Eftir bleyti skaltu nota mjúka-burstann til að skrúbba yfirborðið varlega; fyrir þrjóska bletti gætirðu beitt aðeins meiri þrýstingi. Þegar hreinsun er lokið, skolaðu mottuna vandlega með hreinu vatni til að tryggja að engar leifar af þvottaefni séu eftir; notaðu síðan handklæðið til að þurrka það og gætið þess að þrýsta því ekki kröftuglega út þar sem það gæti valdið aflögun.
Ef sílikonmottan heldur óþægilegri lykt geturðu bætt litlu magni af hvítu ediki út í skolvatnið eftir hreinsun og lagt í bleyti aftur til að eyða lyktinni. Fyrir sérstaklega þrjóska bletti er mælt með því að nota sérhæft sílikonhreinsiefni þar sem það býður upp á frábæra hreinsunarafköst. Eftir hreinsun skaltu setja sílikonmottuna á vel-loftræstu svæði til að loft-þurrka náttúrulega og forðast beint sólarljós.
Mismunandi hreinsunaraðferðir hafa sína kosti og galla: Venjuleg þvottaefni eru ódýr en bjóða aðeins upp á meðalgetu til að fjarlægja bletta-; sérhæfð sílikonhreinsiefni eru mjög áhrifarík en kosta hærra; og að liggja í bleyti í hvítu ediki hjálpar til við að útrýma lykt en getur verið örlítið ætandi fyrir ákveðin efni.
